原核细胞含有细胞壁（支原体除外），原核细胞没有核仁，只有拟核。进化地位较低。细胞器只有核糖体，有细胞膜，成分与真核细胞不同。细胞较小，没有成型的细胞核，没有染色体，DNA不与蛋白质结合。
真核细胞和原核细胞的比较
| 类 别 | 原核细胞 | 真核细胞 |
| 细胞核 | 无成形的细胞核，无核膜、核仁、染色体，只有拟核 | 有成形的细胞核，有核膜、核仁和染色体 |
| 细胞质 | 只有核糖体，没有其它复杂的细胞器 | 有核糖体、线粒体等，植物细胞还有叶绿体等 |
| 细胞壁 | 细胞壁主要成分是肽聚糖 | 植物细胞壁的主要成分是纤维素和果胶 |
| 分裂方式 | 二分裂 | 有丝分裂、无丝分裂和减数分裂 |
原核细胞型微生物
原核细胞型微生物是指没有真正细胞核（即核质和细胞质之间没有明显核膜）的细胞型微生物。是仅次于非细胞型微生物的最小的一类微生物。无典型的细胞结构,染色体仅为单个裸露的DNA分子，无核膜和核仁。细胞壁由肽聚糖构成，缺乏完整的细胞器。
