平行志愿填报高校也有先后顺序，而且这个顺序还很重要。平行志愿的投档，不是不遵循志愿，而是在分数优先的前提下遵循志愿的顺序来进行。
关于平行志愿的录取
平行志愿的投档原则是“分数优先，遵循志愿，一次投档”。对同一科类批次线上未被录取的考生按成绩从高分到低分排序进行一次性投档。本科平行投档时根据考生所填报志愿院校顺序，投档到排序在前且有计划余额的高校。分数优先，是指招办按考生总分排序后依次投档，比如说，某考生所报志愿为A、B、C、D等四所院校，录取时，批次线上考生先按分数大排队，然后由计算机逐一检索考生志愿，如果考生符合A校投档条件，则投档到A校;如果不符合A校的投档条件，则检索B校，若符合投档条件，则投档到B校，若不符合，继续检索，依此类推，直到检索到考生分数符合的院校后，将其投档至该校。档案一旦投出，即不再检索该生其它志愿。
平行志愿投档规则
所谓平行志愿，即一个志愿中包含若干所平行的院校。平行志愿按照“分数优先，遵循志愿”的原则进行投档，对同一科类分数线上未被录取的考生按总分从高到低排序进行一次性投档，即所有考生排一个队列，高分者优先投档。每个考生投档时，根据考生所填报的院校顺序，投档到排序在前且有计划余额的院校。
平行志愿有什么好处
一是降低志愿填报风险。以前填报志愿，第一志愿落空，很可能导致第二、三、四志愿也随之落空。而实行平行志愿，依据“分数优先”的原则进行投档，第一、二批本科的A、B、C、D四个平行志愿，与第三批专科(高职)A-H的8个平行志愿，都有被录取的可能性。
二是减轻考生在志愿填报过程中的焦虑心态。以前填志愿，几大“金刚”不可能出现在同一张志愿表中，比如把复旦、上海交大、同济填在同一张志愿表上，会被认为是严重的填报失误，考生必须在这几所学校中选择一所作为第一志愿，这种选择增加了考生的焦虑。而平行志愿填报，可以将与自己实力对应的相同层次高校放在一起。志愿填报的风险减低、焦虑减轻、选择空间增大，因而考生高考的紧张情绪也会减轻一些。
三是很大程度保护了高分考生。以前由于一分之差，可能导致高分考生从名校落到一般高校。而在平行志愿中，高分考生遭遇“滑铁卢”的可能性大大减小，只要定位准确、志愿搭配合理，高分考生可以更充分地选择理想的学校与专业。
平行志愿录取规则
1、志愿并列。考生所填报的多个院校相互并列。即在同一投档时间段，考生所填院校均有可能被检索。
2、位次优先。在检索考生填报的院校志愿前，首先要将所有考生分科类按投档分(高考总分加政策照顾分)从高分到低分进行位次排列。投档检索时，先从最高位次考生志愿检索，再依次检索以后位次的考生志愿。
3、遵循志愿。考生所填报的多个院校仍有自然顺序。检索考生所填报的几个院校志愿时，是按考生填报志愿时排列的院校自然顺序依次进行的。当考生的投档分达到首先被检索到的院校投档线时，该生即投到该院校，由高校择优录取。考生档案一旦投出，即不再检索该生的其它志愿。
4、一轮投档。由于考生所报志愿是平行的，故投档检索只能进行一轮。如果考生因几个平行志愿均未满足条件而未被投档，或投档后被院校择优后退档，就只能参加征集志愿或下一批次录取。
