2016年2月23日，中国科学评价研究中心、武汉大学中国教育质量评价中心联合中国科教评价网隆重推出《2016年中国大学及学科专业评价报告》，发布了中国大学本科专业排行榜，共涉及478个本科专业。
下面公布2016-2017年生物工程专业排行榜的前20强名单。
生物工程专业排名数据
| 排 序 | 学校名称 | 水 平 | 开此专业学校数 |
| 1 | 华中农业大学 | 5★ | 248 |
| 2 | 厦门大学 | 5★ | 248 |
| 3 | 西安交通大学 | 5★ | 248 |
| 4 | 浙江大学 | 5★ | 248 |
| 5 | 上海交通大学 | 5★ | 248 |
| 6 | 江南大学 | 5★ | 248 |
| 7 | 天津大学 | 5★ | 248 |
| 8 | 华东理工大学 | 5★ | 248 |
| 9 | 中国农业大学 | 5★ | 248 |
| 10 | 南京工业大学 | 5★ | 248 |
| 11 | 西北农林科技大学 | 5★ | 248 |
| 12 | 天津科技大学 | 5★ | 248 |
| 13 | 重庆大学 | 5★ | 248 |
| 14 | 东南大学 | 4★ | 248 |
| 15 | 华南理工大学 | 4★ | 248 |
| 16 | 浙江工业大学 | 4★ | 248 |
| 17 | 湖南农业大学 | 4★ | 248 |
| 18 | 沈阳药科大学 | 4★ | 248 |
| 19 | 四川大学 | 4★ | 248 |
| 20 | 中山大学 | 4★ | 248 |
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